故事是以四方田千纱的自杀拉开序幕的。四方田千纱自杀的时候，留下了全剧发展的线索，她说：像我这样的人，原本不应该存在在这个世界上。为什么不应该存在于这个世界上？能不能获得突破？岩仓玲音在之后做出了证明。她自杀后，作为她的同学陆续收到了死者的电子邮件。在同学间引起了惊恐和骚动。岩仓玲音此之前一直从来没有注意过或者说刻意逃避的问题——生与死，便骤然展现在她眼前。她问四方田千纱：可是，为什么要死呢？四方田千纱回答：生和死，其实都是一样的。没有什么不同。人不需要肉体。在四方田千纱自杀风波过后，玲音就好像一个被激活了的程序，突然间开始意识到自己或者说自我也就是本我实体的存在。她逐渐发觉这个世界有点异样。或者说她自己有点异样。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
极度怕麻烦的某大学（注：原作漫画为普通高中）男生江浩一某天忽然成了全校的后宫之王！同时被众多美女同学表白！连江浩一本人也不知道究竟发生了什么，因为自己根本不认识她们！~
17年前，非洲战场上突然出现了不会死的“人类”。而自从那之后，人类当中频繁地出现了这种不死的新物种，因此被称为“亚人”。主人公永井圭在遭遇交通意外之后被确认了是亚人，不想成为实验动物的他，便与好朋友海斗，展开了浪迹天涯的旅行。
在人类、妖怪、混沌三种势力相互并存争斗的世界里，伴随着现实总数和负熵的崩溃。从杰巴沃克的迷宫中逃离的美少女筝，在持续追寻着“黑兔”的踪影，另外还有各种各样的人们跟筝一样也在追寻着“黑兔”。在时间静止的京都这个舞台上，一场幻想动作剧即将上演。
故事是讲述世界的人口因为不明原因而急降，逐渐步出历史的舞台，取而代之的是一种平均身高只有10公分 、三头身的妖精。这些妖精拥有高智能，而本作的女主角则成为了人类与妖精之间的调停官，负责斡旋在妖精与人类之间的重要事务。虽然如此，由于妖精很少与人类接触，所以女主角根本没什么工作可做，于是她想要好好研究妖精的生态，本作其实就是她与妖精们互动的观察日记了。
——华生追寻挚友失却的灵魂的旅程
「经证实，与生前相比，人死后体重会减轻21克。这就是灵素的重量，也就是所谓灵魂的重量。」
19世纪末，「死者复活技术」高度发展，尸者作为劳动力得到广泛应用。伦敦的医学生约翰·华生，在明知违法的情况下，将死去的挚友星期五做成了尸者。而这也是星期五生前托付给华生的殷切愿望。
华生的违法行为被谍报机构「沃尔辛厄姆」发现，华生也因此受命去搜索《维克多手记》。《维克多手记》是一百年前维克多·弗兰肯斯坦博士遗留的文书。据信在那里面写有，孕育出据传与生者同样拥有意识的最初的尸者The One的终极的技术。
华生与星期五从印度孟买向阿富汗内陆进发。目标是沙皇俄国牧师、天才尸者技术者阿列克塞·卡拉马佐夫。与新型尸者一同消逝在那里的卡拉马佐夫，或许拥有《维克多手记》。
华生与英国军人伯纳比汇合后，由俄罗斯的特务尼古拉带路开始行动。未尝想到，这只是华生周游世界的冒险的起点。从阿富汗到日本，再到美国，华生的冒险如此持续下去。
让星期五再度获得灵魂——华生的夙愿，能够在旅途的终点得以实现吗？
生存在现实世界的人们，总是不得不面对各种各样不合理的事。各自的人生经历、朋友关系、家人，以及对未来的恐慌。当某一个人最终的结局——“死亡”来临之时，已死去或者依然活着的人，是否已经了无遗憾？
“如果，能够将死去的人最后的遗言传递给活人……”流传在都市角落里的传说，正是跟一个总是将死者最后的遗言传递给生者的少女有关。这种由已经死去的人，寄给依然活着的人的信，被称为“死后文”，负责传递这种奇妙信件的少女，就是来自于死后世界的邮递员文伽。
死后文里记载的，是死去的人从人世间所带走的最后情感。有怨恨，有思念，有悲伤，有喜悦…文伽见证着死者与生者的种种羁绊，并看透了世间的人情百态。甚至于众多难以想象的诡计与阴谋，也都在死后文里揭露出了原本的面目。
对于用鲜血和虚伪所掩盖的真实来说，死亡，绝不是人类最后的终点……
在和美丽吸血鬼遭遇的春假之后，主人公阿良良木历迎来新学期，从新学期的第1个月开始到大学入学考试为止，这1年间每个月所经历的故事。
主人公小森唯是一名除了有灵感体质以外普通的高中二年级学生，某日，因为父亲的工作调动以及不吉利的传言而转了学校，同时还住进了被称为“妖怪公馆”的地方。与在那里的六名兄弟同居的日子里，她发现他们并不是普通的人类，于是不安与恐怖的新的学园生活正式拉开帷幕……
故事主要讲述了3个少女和9个少年去旅行。 像明治大正一样的古老街道， 街上的人们皆穿着日式服装， 并且存在着与那样的街道极不相称的巨大球体。 仿佛丢失了重力这个概念一样慢慢地在空中飘浮着， 那个球体的名字是「NORN」。是载着年轻人们在天空旅行的广大的船……