Hand Shakers——将手牵起，利用从深层心理诞生的武器“宁录”互相战斗的人们。
为了实现自己的“愿望”，从而见到神，将神打破，众多的Hand Shakers以那个顶点为目标，互相竞争。存在于那尽头的事物是——。
——大阪
擅长摆弄机械的高中生·手纲，接受了某个修理委托而来到大学的研究室。他在那里，与一直睡在床上的一位少女·小代理相遇了。如同被什么引导一般触碰到小代理指尖的手纲，听到了从某处倾注而下的声音。
——跨越众多战斗，超越试炼之人。
接受启示之人。企图见到我，挑战我之人。其为“Hand Shaker”——
由于在眼前延伸的异质世界“金字形神塔”而困惑的手纲。刹那间，手纲和小代理遭到了某人的袭击——。
企图见到神的诸多Hand Shakers，阻挡在手纲和小代理的面前。赌上他们各自的“愿望”……。
去守护吧，用这双手。
秋叶原——从新手到老手通通接纳，有着深厚包容力的街道。即使独自一人，只要去了秋叶原也会遇到理解自己的某人。可以做到、感觉能够做到什么事的自由场所，无论身心都可以尽情裸露在外的街道。
在不论动画、游戏、女仆、偶像、废品、B级美食，全部都充满了“秋叶原”的这条街道上，与破缲者战斗，不会停歇的“BOY MEETS GIRL”的故事，就此开始！
2015年，涩谷。在从6年前发生的大灾害“涩谷地震”当中复兴的城市所新设的私立高中“碧朋学园”就读的少年宫代拓留，追寻着作为自身设立的新闻部活动一环的、被称作“新时代疯狂的再来”的连续杀人事件……。
这是一个以占卜行业为主轴的小镇，国内憧憬著占卜师的少女们都在身处其中以成为“Urara”为目标而努力着。其中一位来自深山、名为“千矢”的少女也在因缘际会下来到这个小镇，并意外遇见三位同样以“枣屋”为目的地的可爱女孩“绀”、“小梅”和怕生的“乃乃”，个性截然不同的4人，将一同在迷路镇追踪各自梦想！
高二学生西条拓己，自称“对三次元没有兴趣”，住在名为“基地（BASE）”的集装箱房子里。过着被大量美少女手办包围的生活，距离家里蹲只有一步之遥。在他居住的涉谷地区，发生了名为“疯狂New Generation（通称：NewGene）的连续猎奇杀人事件。在电视和网络上都引起了骚动。某一天，拓己在网上聊天时，遇见了一位自称“将军”的人。“将军”对下一次NewGene事件做出了预言。拓己小心地点开了其中的超链接，映入眼中的是血腥的画面。次日，拓己目睹了凄惨的事件现场。而且，受害者正是按照预言之中的方法所杀。连续猎奇事件的阴影，向着拓己安稳的日常生活袭来……
2006年，13岁就出道的天才少女作家堇川奈奈子千里迢迢来到香港，为的是出席即将改编成电影的她的畅销书签名会。然而就在路上，忽然遇上了有人策划的爆炸袭击，幸好陪伴在一边的导游米歇尔和玛姬反应过人让她逃过一难。随后得到了一封警告信，扬言要取堇川性命的匿名歹徒将不惜一切让她死在香港。警方闻讯对签名会场进行了严密戒备，而米歇尔和玛姬亦向堇川透露了自己身为“三姐妹侦探社”的身份，决心连同小妹阿尼塔作为保镖保护她的安全。
签名售书当日，歹徒仍然混进了会场突然发难，用炸弹将堇川挟持。原来这名文学青年因为自己的小说无人问津而对外国人堇心存嫉妒，但令他和堇川都万万没有想到的是，米歇尔、玛姬和阿尼塔三人都是会操纵纸片的“THE PAPER”，一直在寻找失踪好友的读子·利德曼的堇川，终于发现了唯一的线索……
在人类与敌人——“Unknown”持续战争的世界。
数十年前“Unknown”侵略时被送往冷冻睡眠设施避难的孩子们，从沉睡中醒来之时，得知自己的身体中被发现了超自然的力量——“世界”。为了从出现在东京湾的“Unknown”手中保护国家，少年少女们在东京、神奈川、千叶的各防卫都市展开战斗。
东京由相乐总、神奈川由橘公司、千叶由渡航担当，创造出“QUALIDEA”的世界。
故事发生在绿色都市——风祭。居住于这座以“文明与绿色共存”为理念而兴建的都市里的天王寺瑚太朗，与神户小鸟、吉野晴彦等伙伴过着平凡的每一天。
在那么和平的风祭市里，每年都有一段时间特别热闹，那就是举城欢庆的收获祭。为了这个类似于文化祭的大型活动，瑚太朗开始干起收集新闻素材的工作。
同一时间，瑚太朗的身边也开始出现种种无法解释的奇怪事件，而在风祭这个地方，正盛行着各种未知生物以及超自然现象之类的流言。瑚太朗开始着手调查这些事件，并向超自然研究会会长千里朱音寻求帮助，还把自己所认识的同学们也一并卷了进来。
这其实是瑚太朗的小小冒险心在作怪。“要是能跟伙伴们一起打打闹闹地生活下去，那该多好啊。”
瑚太朗这时还没有意识到，自己的行动已经和探寻那谁也不知道的“真实”联系在了一起。
——那个女孩的命运，能够被改写吗。
“咒纹”是通过装填每人固有的物质“Trigger”来启动，使被称为“印者”的操纵者的身体能力飞跃性提升，并引发超常现象的超古代兵器——。
赤冢正义（通称：正义）在帮助了被不良纠缠的男性之时，在拿到作为谢礼的神秘石头的瞬间，手掌上刻下了不可思议的刺青。
“这个咒纹，你是在何处得到的？”次日，在放学回家的路上，被身穿不合季节的大衣的少女“伊姬”突然袭击的正义，使用祖父传授的柔术反击，却被压倒性的力量差压制，遭遇性命攸关的危机……。
以偶然得到“咒纹”的赤冢正义为中心，各种各样人们的心思风起云涌的争斗，现在开始
主人公·张楚岚，某天在墓地遭遇僵尸的袭击。在万分危急的时刻，一个少女出现在了他的面前手里拿着的菜刀将敌人击倒对着放心了得楚岚说道“现在这里有些困境，你就自己面对吧”留下了有着深意的话，离开了
过了几天，在大学上学的张楚岚的面前，又出现了少女的身影。自从那个瞬间，张楚岚激荡的命运便开始向前推进了。