被孤儿院赶出、濒临饿死边缘的少年·中岛敦与一群风格奇异的男人们相遇了——。
热衷于大白天跳水自杀、有着自杀嗜好的男子·太宰治。
总是神经质地翻阅手帐的、戴着眼镜的男子·国木田独步。
他们是、能解决连军队和警察都束手无策的怪异事件的“武装侦探社”的成员。
因为某种原因，敦被要求一起同行去击退使街道巷尾都骚动不已的“食人虎”……。
架空的都市 横滨。
怀有文豪之名的人物、登场。
借此之名各类异形的力量如火花四散。
千奇百怪的文豪异能力战斗，在这里开幕！
在中国的轻庆市，出现了“发光的婴儿”出生的事件，人类自此开始了异变。之后，获得超能力的人类在世界各地被发现。随着时间的流逝，世界上超过80%的人类拥有了名为“个性”的力量。但随之而来的是，因为有了“个性”而在世间作恶的人极速增多，于是产生了打击犯罪、解救他人的热门新职业“英雄”。
绿谷出久从小就憧憬一位顶尖英雄、而他的梦想就是成为伟大的英雄。可是，与常人不同的是，出久却是世界上少有的无“个性”的体质，他也因此在梦想与现实间烦恼着、不知是否应当去就读职业英雄高校雄英高校英雄科。在高校考试前的某一天，出久与他从小崇拜的英雄欧尔麦特相遇了、他的命运也随之改变。
箱庭学园一年级的少女黑神目泷，是一名成绩优秀，运动万能，外表秀丽，家财万贯，十全十美的一年级生，于第98代学生会长选举中以压倒性的98%支持度胜出。她根据选举公约设置了“目标箱”，并招揽了青梅竹马人吉善吉和其他特别的朋友为成员，一起解决学生的问题。然而，随着意见箱所引发的事显得越来越高调，统领学园的其他势力开始注意到黑神的异常性。在合作不果后，这群人正式展开各种抗衡的手段……
涉谷发生大规模恐怖活动事件的2年后，少女迦南在上海接受了对抗犯罪组织的要求，经历着与武装集团“蛇”对抗的日子。犯罪组织“蛇”的首领阿璐法鲁多是过去与迦南共同战斗的伙伴，两人分道扬镳之后，一直潜伏在南亚。
另一方面，自由作家御法川在三流杂志社“heaven出版”与他的助手摄影师玛利亚一同去上海取材，玛利亚感觉到她在中东认识的少女迦南就在附近。混合了繁华和杂乱“魔都”上海，被笼罩在曾经震慑涉谷的病毒阴影之下，人们命运再次开始交织在一起。
L.C.922年，人们面临空前的危机。
神话世界Tetraheaven的百年战争终结后，败北的魔神们为了寻求新的安住之地而向人间界Septpia袭来。背负着从异世界使者（Foreigner）手中守护城镇宿命的警察特殊机关ALCA，其下所属的年轻Logicalist们被政府强加上守护街上人们的使命，利用特殊能力与异世界的女神们合体（Trance），投身于战场。
虽然缺少某种“Logic”，却仍然与家人过着幸福生活的民间人·剑美亲，某天在拼命让遭受魔神袭击的人们避难之时，与美丽的女神雅典娜相遇了。她手中所拥有的是，美亲本应已失去的“Logic”。之后，美亲与雅典娜一同，被引导向意想不到的命运。
世界的未来被托付到年轻的Logicalist天生的“运气（Luck）”与“逻辑（Logic）”之上——。
故事主要讲述了3个少女和9个少年去旅行。 像明治大正一样的古老街道， 街上的人们皆穿着日式服装， 并且存在着与那样的街道极不相称的巨大球体。 仿佛丢失了重力这个概念一样慢慢地在空中飘浮着， 那个球体的名字是「NORN」。是载着年轻人们在天空旅行的广大的船……
那扇门，没人知道它“何时、何地、以何种形式”存在着。那扇门，从未有人“看过、接触过、到达过”。
然而，当“门”打开时，人类居住的“常界”、妖精居住的“天界”、魔物居住的“魔界”将彼此交融，世界的秩序将会被破坏殆尽。没有人知道这扇门是如何打开？被谁打开？为了什麼而打开？人们仅仅因敬畏而如此称呼这道门───神圣之门Divine Gate。
在本世纪初，因为恐怖分子袭击阿赖耶识研究所基因实验基地的关系，导致特殊病毒的泄露，从此人类的大脑当中出现了变异，开始能够看到一些幽灵般的存在——“phantom（怪灵）”。而在此次事件前后出生的孩子当中，一部分人就拥有能够跟怪灵战斗的能力，为此防卫省也于中小学内成立“脑功能异常对策室”，安排孩子们解决怪灵问题。主人公·赫塞亚学院高一学生一条晴彦便是其中的一员，而他跟前辈川神舞、被称为“怪灵吞噬者”的和泉玲奈以及“反怪灵要员”水无濑小糸一起投入到同怪灵的作战，然而世界的真相还在等待他们去揭开……
东京，池袋。
向往都市生活的少年龙之峰帝人接受从小一起玩到大的好友纪田正臣邀约离开家乡来到东京进入池袋来良学园上学。
而在池袋有几个绝对不能招惹的人物，尤其是被誉为“最强”的平和岛静雄和经营情报屋的折原临也这两个人。另外，池袋有一个正体不明的独色帮组织，名叫“Dollars”。
然而，就在上京的第一天，因为对池袋复杂的关系而感到不安的帝人就亲眼目睹了骑着黑色摩托在街头穿行的都市传说“无头骑士”——塞尔提·史特路尔森。
于是，随着池袋接连发生的砍人魔事件，无头骑士、Dollars、砍人魔、黄巾贼等陆续浮出水面，围绕着一串串谜团，池袋正面临着崩坏中，一连串非日常的故事开始了。
恶魔幸存者2全集故事讲述某个星期天的突发事件，神秘的侵略者袭击了日本全领。这些侵略者每天都会展开一次袭击，每次袭击都会令人们陷入恐怖和绝望的境地。在这么一个极限状态下，出现了13名“恶魔召唤者”，他们和恶魔展开契约，获得了与神秘侵略者对抗的力量。而他们所剩的时间只有7天。