泡沫战争十数年来，世界富人和穷人的两极分化急剧地发展，日本也没有例外。富人只顾寻求自己的欲望和快乐，东京化作了满足这种欲望的快乐都市。在某个秘密俱乐部里，那是个只有特别选出的人才能被允许出入的的黑暗的社交场。而且会员中有人还能被赐予终极的快乐。
被剥夺了护照，只好呆在国内的战地摄影记者杂贺，某天被托付了潜入哪个秘密俱乐部取材的任务。在杂贺抓拍现场的同时一名叫天王洲神乐的神秘女子突然出现，其实哪女子是被俱乐部支配人水天宫作为俱乐部的象征操纵着。神乐开始向杂贺求助，因为同神乐的接触而得到了奇妙能力“写杀”的杂贺便带着神乐逃出了俱乐部。后遭了水天宫所命令来自俱乐部的追赶者，也是根据欲望得到了“特殊能力”的人们所追杀而发生的一系列事件。
作品以21世纪初的日本某乡镇为舞台，描绘著一名高中少年“阿良良木历”与少女们遇到许多日本民间传说的怪谭故事。本作品跟一般怪谭故事不同，不以击退妖怪或寻找事发原因之类的解谜作为主线。作品主要透过对话，为男主角和少女们之间的内心作深刻描写。对话多到让主要事件差点完全中断，亦加入了许多后设以及对社会和其他作品的讽刺。故事之中还加入了恋爱喜剧，以及详细的动作元素，可说是作者把想要的东西都写进去的作品。所以，作者自评本作为他的自信作，亦称之为“以很难媒体化为目的而写的小说”。
女主角桃园奈奈生因好赌而欠债的父亲不知去向，被讨债的人赶出了家。在走投无路之时，她帮助了一位被狗追的懦怯的男人，得知她的遭遇后神秘的男人说出了“我把我的家转让给你吧。”这样出奇的话。无家可归的奈奈生虽然半信半疑，但还是前往了男人所说的住所……到了那儿发现那是一间荒废的神社。那懦怯的男人的正体正是离家出走的土地神。作为神社转让的代价，奈奈生开始了当土地神的新生活。
故事讲述来自因帝国镇压而痛苦不堪的村子的少年剑士塔兹米和幼驯染的伙伴一起出发前往帝都谋生，在抵达帝都的途中遇到歹徒夜袭，与伙伴分离孤单一人到达了帝都。在到达帝都的第一天就被骗光了所有钱的塔兹米，被贵族的大小姐艾莉亚收留回家。在一次与艾莉亚一起去买东西的途中，意外地得知了帝都黑暗的真相。此后塔兹米与帝都的无情杀手集团NIGHT RAID的赤瞳相遇，决定以NIGHT RAID一员的身份对抗帝都的所有恶势力。
某一天，最强的魔法使公主锁部叶风被部下左门暗算，困在了无人荒岛；又有一天，一位少女被唐突杀害，犯人还未逮捕时间却已流逝；然后又在某一天，围绕着复仇与魔法，超越时间与空间战斗正式揭开了序幕！正气和狂气，理性和知性，自信和确信。在悲剧性的不合理的世界里，少年少女们的命运交缠纠结，故事开始了。
107年前（743）年，世界上突然出现了人类的天敌“巨人”，面临着生存危机而残存下来的人类逃到了一个地方，盖起了三重巨大的城墙。人们以自由为代价，在这隔绝的环境里享受了一百多年的和平，直到艾伦·耶格尔十岁那年，50米高的“超大型巨人”突然出现，以压倒性的力量破坏城门，其后瞬间消失，巨人们成群的冲进墙内捕食人类。
艾伦亲眼看着人们以及自己的母亲被巨人吞食，怀着对巨人无法形容的憎恨，誓言杀死全部巨人。城墙崩坏的两年后，艾伦加入104期训练兵团学习和巨人战斗的技术。在训练兵团的三年，艾伦在同期训练兵里有着其他人无法比拟的强悍精神力，即使亲眼见过地狱也依然勇敢地向巨人挑战的艾伦，如愿以偿加入了向往已久的调查兵团。
主人公·秋山奏隶属于学校的天文学会，而天文学会当中有着许多个性丰富的成员。他们在一起解决发生在内滨学园的各种怪异事件。而他之所以加入天文学会，也有着一段不为人知的故事：某天因为受伤的关系，他放学后不得不继续留在学校的保健室当中，这时他却听到教学楼方向传来奇怪的声音。而当他急忙赶到现场后，居然发现一名全裸的少女倒在地上！这个名叫古川结的少女虽然没有明确表露身份，但似乎早就认识秋山奏的样子。第二天古川结就加入了天文学会，之后受到学生会的委托，开始与天文学会的成员一起调查学校周围发生的“校内幽灵事件”、“睡眠病”、“事故频发地区”等灵异事件……
国中二年级学生天野雪辉习惯远离所有人，以一个旁观者的角度把亲眼所见的事当作日记记录在自己的手机中。一天，时空之神Deus把未来日记植入他的手机，日记中记录的是他未来90天发生的事，包括考试内容、遇到的危险等。
这个日记代表着持有者的未来，一旦被破坏，持有者将会同日记一同消失。Deus选定了十二位未来日记的持有者、他们之间将会进行一场生死游戏，而最后生存的人将会成为Deus的继承者，掌握支配时空的神之座。起初、弱小的雪辉选择联手爱慕自己的我妻由乃；随着游戏的进行，雪辉渐渐发现由乃的奇怪思想及行为。
而故事也向着内向冷淡的雪辉的成长、盲目爱慕雪辉的我妻由乃的动向、以及十二位独具个性的未来日记所有者进行的斗争展开。
本作以与现实中有微妙差异的现代日本为舞台，讲述了昵称为“小白”的 少年伊佐那社是引发某起事件的嫌疑人，而本人却对此毫无记忆。为了调查事情的真相，“赤之王”周防尊率领吠舞罗，“青之王”宗像礼司率领Scepter4，都在全力追赶伊佐那社，并在追赶的过程中互相冲突。莫名其妙的伊佐那社亡命奔逃，邂逅了一身黑衣的长发少年夜刀神狗朗（即前任无色之王的弟子），从此，伊佐那社的命运之路飞速的向着不可知的方向发展……
主角春日野悠和他的双胞胎妹妹穹在父母死于事故之后，来到了位于名叫奥木染的小村的祖父的家中，在那里开始新的生活。一边和不习惯的家务事奋战，一边还要照顾平时足不出户、什么事情都不会的妹妹穹，悠的生活变得异常艰辛。
在与昔日到访奥木染时认识的天女目瑛和依媛奈绪重遇、认识了新的朋友、和以前一样几乎没有变的城镇和人们。这令人怀念的回忆和温馨的环境，治愈着悠心中的伤痕。在这样的过程中，慢慢地发生了一些变化。儿时定下的只属于两个人的秘密约定以及所失去的重要东西的下落。还有，定下了这个地方的真正理由。很快悠注意到了对自己来说谁是重要的存在……
面对伤痕累累，一路蹒跚走过的她，悠要如何面对呢？在阳光灿烂的初夏天空下，故事，就这样开始了……