被谜之转校生——千斗五十铃强迫而接受游乐园约会的可儿江西也，不知何故被拉到的地方，却是一个充满了破旧游乐设施的日本第一的遗憾游乐园——甘城辉煌游乐园。这座游乐园建立于泡沫经济全盛期，近年假日来客人数不超过3000人，同时也是臭名远播的最糟约会地点代名词，现在最大的问题是，三个月内来客人数如不满50万人就得关闭。
被引荐给了游乐园的管理者，“真正的”公主——拉媞珐的西也，不知为何突然被托付了重建这个陷入闭园危机的游乐园的重任。
原来，这里不是游乐园——？！
水明艺术大学附属高中校外独立宿舍，通称“樱花庄”是群聚了一群充满各式问题学生入住的特殊公寓，被一般人作为“怪人的巢穴”看待。因无法抛弃弃猫而被赶出一般宿舍的主人公神田空太也是其中的一份子。
本来应该以“脱出樱花庄”为目标的空太，却由于天才画家椎名真白的入住，导因于其连穿衣服都无法完全自行处理的“超”字辈等级的生活白痴水准，空太莫名奇妙的肩负起有如宠物般的“饲主”责任，开始了照顾真白和被其耍弄的哭笑不得的日子。
作品以 2022 年为舞台，大厂牌电子机械制造商“ARGUS”开发出－“NERvGear”－能连结虚拟世界的机器。完全的虚拟实境终于能够实现。主角桐人使用 NERvGear 游玩 VR MMORPG《Sword Art Online》的玩家，幸运地参与过封测并买下正式版的桐人，和正式营运就马上“完全潜行”享受着正式版的 SAO 世界。
就在游戏四小时多后，桐人发现到“登出”指令竟然消失。认为只是系统暂时出错的桐人和开始陷入混乱的所有玩家们一起被传送到开始地点广场，并传来游戏设计者的死亡游戏说明：不能登出是游戏的正常现象，只有打倒位于“艾恩葛朗特”顶楼的头目，达成“完全攻略”才是离开这个世界唯一的方法……
这是一个人类失去制海权的世界。蹂躏大海的威胁叫做“深海栖舰”。
可以与这种威胁进行对抗的，只有被称为“舰娘”的继承了存活舰艇之魂的女孩们。对抗深海栖舰的舰队据点就是“镇守府”。那里汇聚了形形色色的舰娘，她们每天都在那里切磋训练，那里是大家共同生活的地方。某天，镇守府迎来了一名新舰娘。她是特型驱逐舰——名叫“吹雪”。吹雪的舰娘物语现在开始。