那里是能够映照出耀目阳光的海底，是以人类姿态并且纯洁无垢的少女、跟鱼类共同生活的地方。名为玛琳女孩，是居住在海的世界里，跟妹妹乌琳一样对空之世界充满憧憬的海人。
有一天，一只美丽的戒指落入海的世界里。玛琳和乌琳两姐妹为了把戒指交还给原本的拥有者而初次离开了海的世界。
两人好不容易的来到了一个周边被海所包围的小岛。有一位名叫夏音的女子高中生在这个在小岛上生活着。她是一名性格阴暗的少女，之前被男朋友法兰欺骗，现在对日常生活均不抱任何希望。而事实上夏音正是玛琳她们在寻找的戒指的主人。因命运而相遇的玛琳和夏音，不久后隐藏在两人体·..
一所位于东京都千代田区的传统高校“音乃木阪学院”，因为入读的学生人数骤减，所以正面临着废校的危机。其中有九名少女想到一条妙计——成为偶像，只要她们成为偶像，学校的名气便会增加，而入读学生的人数亦会上升。就这样，九位个性鲜明的少女决定一起努力成为偶像，希望可以凭借偶像的名气增加生源来挽救自己所喜爱的校园。
故事舞台设定在一个名为“10年黑组”的全住宿制女子高中的班级，这个班级里的12名学生都是由暗杀者构成的，她们全都瞄准了她们的同学——一之濑晴的性命。即使她的性命被众多人觊觎，一之濑晴依然发誓一定要活着毕业。另一方面，同样也是准备夺取一之濑晴性命的暗杀者——转校生东兔角却在一次次接近对方时，渐渐地被晴所吸引。在同学们对晴展开攻击之时，兔角则以保护者的姿态与她们开始了战斗。
这间女校都是女生，加奈子转来之后，发现每个学妹都好萌喔！原本对男生过敏的她，好高兴再也不会起荨麻疹了。但就在加奈子徜徉在幸福梦幻之际，却发现事实不是这样…
刚转入天妃女学院高二的宫前加奈子，最喜欢美少女，却非常害怕男人，只要碰到男人就会浑身过敏，冒出一颗颗的荨麻疹。加奈子才刚踏进校门，就发现天妃的美少女机率非常高，不禁满心欢天喜地。没想到却意外发现“美少女”祇堂鞠也的秘密，两人还成了室友！于是加奈子又悲又喜的校园生活，就此展开！
私立莉莉安女子学园创立于明治三十四年，原本是为贵族的千金小姐而设，是一所具有深厚传统的天主教女子学园。学园位于东京郊外的武藏野，四面环翠，被诸神守护，是为少女提供幼儿园直通大学的精英教育的乐园。
在莉莉安女学园的高中部，存在着一种叫soeur（法语：姐妹）的系统。像是姐姐带领着妹妹一样，学姐指导着学妹，就算没有严厉的校规，也能传承纯洁正派的学园生活。
学园由相当于普通学校学生会的山百合会管理，其正式的干部成员只有“红蔷薇”“黄蔷薇”“白蔷薇”3位蔷薇大人。蔷薇大人的妹妹们则称为花蕾，作为下届的蔷薇，被大家所认同。
某天清晨，学园的普通一年级生福泽祐巳在向圣母玛利亚的雕像祷告时，被人从后面叫住了。而声音的主人就是红蔷薇的花蕾，莉莉安女学园的明星，小笠原祥子……
小小的领巾促成了命运的邂逅，也拉开了这段美丽少女物语的序幕。
故事的主角是以治退专吃人类魂魄的魔人（ヴァイアラス）为职业的的退治
维纳斯VS病毒屋·露茜亚（ルチア），跟她一起与魔人战斗的还有偶然被露茜亚的胸针刺到卷入事件之中而得到了神秘力量的少女鹰花堇。有一天小堇在和一个叫与识的青年在公园中遭到了使用雷之力的迷之少女鲁卡的袭击，出于想要保护与识的强烈意愿，不知不觉中堇自身不可思议的力量也被唤醒了，于是接受了名桥的实验委托……
逢泽夏海正在读中学2年级的运动型少女，在居住的城市中，夏海有三个十分要好的朋友。作为网球搭档的，运动和学习都很优秀的水越纱季，个性活泼可爱的旅馆家女儿花木优香以及身材娇小个性沉默，对音乐有着狂热爱好的环凛子。
在静冈县下田市这个宁静的小城市中，交织着四个少女小小的喜怒哀乐，她们一同上学，一同回家，一同分享各自幼稚的秘密。同样的，当嫌隙发生的时候，唯有坚实的友情能将四人维系在一起。这个夏天，这样的海边，少女们能够用相互的羁绊共同创造属于他们的奇迹吗？
留宿在学校的“学园生活部”的4名成员，气氛制造者的由纪、喜爱铲子（？）的胡桃、带领着大家的悠里、可靠的学妹美纪。在温柔的顾问慈姐的守护之下，她们早上起来拿面包干当早餐，在屋顶的菜园收获小西红柿，追着从房间里逃出来的小狗“太郎丸”跑遍整个学校……虽然有时也会发生些不得了的事情，但大家一起生活的每一天仍然满溢着在那之上的快乐。她们的“学园生活部”今天也元气满满地活动中！
然而，在这份看似幸福的日常中却隐藏着……
有着灵感体质的女高中生天海响，身边总是聚集着很多的灵，它们和围在天海身边的愉快伙伴们一起演绎出有笑有泪的治愈系喜剧。
在面积占据东京都西部的三分之一，居住着230万名人口，其中八成人口是学生的巨大都市“学园都市”中，学园都市和外部隔离，研究最尖端科技。所有学生都接受超能力开发，并大都借由药物、催眠术与通电刺激等方式取得超能力。有各种类型不同能力，以范围和威力分为无能力者、低能力者、异能力者、强能力者、大能力者和超能力者。故事从学园都市最强的电击公主“超电磁炮”御坂美琴，某天认识了和白井黑子一样担任风纪委员的初春饰利开始……