故事叙述就读于埼玉县某中学的平凡中学生主角满潮永澄，在暑假时于濑户内海祖母家游玩，而在海中遇溺之时遭人鱼少女濑户拯救，但因人鱼世界中的一条规矩，被人类看见人鱼真身的话，双方中的一方就必须选择死亡，而能回避这向规矩的最后手段，就是成为人鱼家族的一员。
灿借此机会向永澄求婚，但遭到灿的父亲豪三郎的极力反对，而豪三郎乃是人鱼族的黑社会集团濑户内鱼类连合濑户组的老大，这桩婚姻却不被灿的黑道老爸看好，甚至从中作梗破坏。灿追随著永澄来到了他所就读的矶野第三中学校，充满暴力（？！）风情的青春爱情喜剧就此拉开序幕。
“失在羊群之中的狼,被寂寞的利齿撕裂自己的身体”。自幼丧母的高城一砂，从小被父亲好友江田夫妇收养，一直不知道父亲及姐姐千砂的消息。一日一砂晕倒在画室，内心烦躁不安，回到小时候一家人生活在一起时住的老宅，无意间遇见一位长发及肩的少女，她就是姐姐高城千砂。仓促间姐弟相认，一砂得知两个出人意料的事实——一是他们的父亲已死于自杀，另外就是他们高城家族流传着诡异的血统，容易得上嗜血的怪病！！而千砂和一砂都不幸成为这种病的受害者。千砂不断亲近一砂，不但因为两人同病相怜，还因为一砂长得酷似父亲，而千砂对父亲有一种难以言说的依赖感…后来姐弟两人在老宅相互扶助着生活，彼此产生了超越亲情的“第四类”感情。然而千砂的身体愈加虚弱，最后在一砂身边静静辞世。绝望的一砂服下了毒药。可怜他并没有死，连病也奇迹般痊愈了，终于成为一个普通人。失去的，只有记忆而已……“我们不是狼，我们只是长着獠牙的羊”。
神魔，是从黑暗世界中逃出的潜伏在人们心灵软弱处将人类引导入死亡的一种东西……而将这样神魔再次赶入黑暗世界的就是一位美丽的吸血鬼——美夕。
《吸血姬美夕》TV版中，故事围绕着吸血鬼美夕与她的一个非常可爱的小宠物死无，以及她的朋友（关系暧昧）拉法与神魔间的斗争展开的。基本上是一集打跨一个神魔的单独小故事，但是其中穿插着美夕与一心要打倒她的雪女冷羽和最后的神魔、亦即美夕的好朋友千里之间的恩怨作为主线。
美夕是东方的吸血鬼，奉命守护自己的魔界，与西方习惯意义上的吸血鬼不同，她不是为了伤害人类而存在的恶鬼，而是降妖驱魔的吸血姬。但由于她独特的身份和封印神魔的方式，再加上人与魔不断的互相纠缠，使得吸血姬美夕成为一个在作品中毁誉参半的主角，她救过很多被神魔纠缠的人，也将不少和神魔纠缠甚深的人类送到了冥。就如同双刃剑一般，无法断言成败得失，但相信很多读者都认同于吸血姬美夕的主要原因在于：美夕每一次将人类送到冥间之时，都可以感受到美夕的无奈和发自她心底的悲伤。
在一次护送公司机密文件的途中，旭日重工的普通职员冈岛绿郎（浪川大辅 配音）遭到了名叫黑礁商会的神秘组织的袭击和绑架，机密文件亦被夺走。为了保证秘密不被泄露，旭日重工采取了消抹行动——包括文件和冈岛绿郎本人。在得知了自己被公司抛弃的消息之后，冈岛决定用自己的方式为自己谋得一条生路。冈岛向黑礁商会提出了入会的要求，并通过实际行动证明了自己的能力，之后以“洛克”之名开始全新的生活。
精明冷静的首领达奇（礒部勉 配音），个性刚强的双枪手薇拉（丰口惠美 配音），开朗淡泊的机械师本尼（平田广明 配音），在这些神秘人物的围绕下，洛克逐渐找到了同伴的感觉，同时，一条充满了危机与冒险的道路也在他的面前展开了。
从梦中惊醒的少女，突然注意到自己在什么东西里面，很柔软的东西，还有从对面传来的声音···。（砾）发现了Old Home的一间房里有一个很大的“茧”正在形成，便急忙开始了准备。原来是同族的新成员要诞生了。
过不大一会儿，好像是受声音的引导，一位少女从“茧”中诞生了。Reki她们（被称为“灰羽”，像天使一样背上生有灰色的羽翼，头上则有优美的光环）正在欢迎她呐。因为一直做着不断落下（Rakka）的梦，所以给她取名叫 Rakka。她的背上果然也生有羽翼，被接受为“灰羽”家族的成员。
在“灰羽”的同族们和“灰羽联盟”的保护下，Rakka在小城里过着安稳的生活。但是，她为什么变成了灰羽，自己究竟是什么，从哪里来的等等，她什么也想不起来了，这令她非常不安···
某天，世界连结到了一起。突然打开的门Highlow，将5个世界连结。
我们所居住的蓝色世界——地球
夜与魔法所支配的黑色世界——Darkness Embrace
祈祷与诸神所守护的红色世界——Terra Rubri Aurora
科学与电脑所管理的白色世界——System White Egma
武器与军队所统治的绿色世界——Gruneschild
天使、恶魔、妖精、魔女、女神。仅在童话中出现的存在，以现实之物现身。
与此同时，觉醒了特殊能力——Excceed的少女们，开始出现在各个世界。
她们被称作“Progress”，并被集中到对她们展开保护、育成的巨大学园都市“青兰学园”。
在这所学园中，少女们相遇了。
与一同编织起牵绊的伙伴们一起。面对5个世界共同的敌人，将世界导向终焉的“Uroboros”。
这个世界，将要失去。能将其拯救的，唯有被选中的少女Progress们——。