为了抵抗突如其来的人类敌人“涅洛伊”，世界各国开始组成联合军队。但是，能对抗它们的只有一群有着特殊魔力的少女们。终于联合军开始的夺回柏林的作战计划，再次集结第501统合战斗航空团“机械化航空步兵”，并有501新成员“服部静夏”的加入，将全面地跟涅洛伊一决生死。到底她们能不能解放柏林的天空呢？