在闹市区的后巷中，平凡高中生藤岛鸣海目睹了一桩突发事件。不日，他被同班同学彩夏带去了她打工的“花丸拉面店”，在这里，他居然又遇到了当天那三个“可疑人物”——柏青哥高手阿哲、“军事宅男”少校以及相貌俊美的宏哥，三人自称为“尼特族侦探”。就在鸣海一头雾水时，他阴错阳差地来到了“NEET侦探事务所”，遇上了一名奇怪的少女爱丽丝。爱丽丝看似是一个足不出户的家里蹲，事实上她是个拥有高超技术的网络黑客，她利用自己的能力接受委托，成为尼特族侦探。
私立莉莉安女子学园创立于明治三十四年，原本是为贵族的千金小姐而设，是一所具有深厚传统的天主教女子学园。学园位于东京郊外的武藏野，四面环翠，被诸神守护，是为少女提供幼儿园直通大学的精英教育的乐园。
在莉莉安女学园的高中部，存在着一种叫soeur（法语：姐妹）的系统。像是姐姐带领着妹妹一样，学姐指导着学妹，就算没有严厉的校规，也能传承纯洁正派的学园生活。
学园由相当于普通学校学生会的山百合会管理，其正式的干部成员只有“红蔷薇”“黄蔷薇”“白蔷薇”3位蔷薇大人。蔷薇大人的妹妹们则称为花蕾，作为下届的蔷薇，被大家所认同。
某天清晨，学园的普通一年级生福泽祐巳在向圣母玛利亚的雕像祷告时，被人从后面叫住了。而声音的主人就是红蔷薇的花蕾，莉莉安女学园的明星，小笠原祥子……
小小的领巾促成了命运的邂逅，也拉开了这段美丽少女物语的序幕。
逢泽夏海正在读中学2年级的运动型少女，在居住的城市中，夏海有三个十分要好的朋友。作为网球搭档的，运动和学习都很优秀的水越纱季，个性活泼可爱的旅馆家女儿花木优香以及身材娇小个性沉默，对音乐有着狂热爱好的环凛子。
在静冈县下田市这个宁静的小城市中，交织着四个少女小小的喜怒哀乐，她们一同上学，一同回家，一同分享各自幼稚的秘密。同样的，当嫌隙发生的时候，唯有坚实的友情能将四人维系在一起。这个夏天，这样的海边，少女们能够用相互的羁绊共同创造属于他们的奇迹吗？
留宿在学校的“学园生活部”的4名成员，气氛制造者的由纪、喜爱铲子（？）的胡桃、带领着大家的悠里、可靠的学妹美纪。在温柔的顾问慈姐的守护之下，她们早上起来拿面包干当早餐，在屋顶的菜园收获小西红柿，追着从房间里逃出来的小狗“太郎丸”跑遍整个学校……虽然有时也会发生些不得了的事情，但大家一起生活的每一天仍然满溢着在那之上的快乐。她们的“学园生活部”今天也元气满满地活动中！
然而，在这份看似幸福的日常中却隐藏着……
有着灵感体质的女高中生天海响，身边总是聚集着很多的灵，它们和围在天海身边的愉快伙伴们一起演绎出有笑有泪的治愈系喜剧。
意大利罗马的某“社会福利公社”是一个以公益事业为幌子从事为政府执行特种任务的特务机构~~其杀手全部由接受义体（人体改造）和条件付与（洗脑）的少女担任~~接受义体和条件付与的最终结果将是记忆的消失与身体的毁灭~~为此公社派出特工专门寻找身体残疾或失去父母的孤儿~~以福利院的名义将她们带回进行秘密改造~~成为强悍而只听命于与之搭档的特工的冷酷杀手“Gunslinger Girl”~~公社的每位特工与一位少女作为搭档执行任务~~这种搭配被他们成为“兄妹”~~
某日在雾弥湖的上空中出现了谜样的圆盘，一度造成全世界的混乱与恐慌，但飞碟却只停留在空中，并没有进一步的行动。在时间流逝中人们渐渐对这件事失去了兴趣……就在两名少女相遇后，静止的时间再次流动，让众人有所改变的全新故事展开，中学生活最后那一年，将拥有一生无法忘怀的回忆。
年方15岁的高中生秋月孝雄（入野自由 配音），专心学业的过程中不得不为了生计打工赚钱。母亲离家出走，他与哥哥过着看不到前方的生活。入梅之日，孝雄逃课来到日本庭园。在一座安静的小亭子里，27岁的职场女性雪野百香里（花泽香菜 配音）边吃巧克力边饮啤酒的样子引起了孝雄的注意。似曾相识的二人，每到落雨之日便从世俗的烦恼中逃脱出来，相会于这座钢筋铁骨都市丛林中宛若世外桃源的幽静角落。在梅雨季节的日子里，他们的心渐渐向彼此靠拢。志愿成为手工鞋匠的秋月，决心以雪野为模特做一双鞋。雨过天晴，艳阳高照，庭园中久久不见秋月和雪野的身影，相会无期亦有期。
《那朵花》是一部用直达内心的笔触描写青春期的少男少女在面对恋情、友情、纠葛时，有欢欣笑容也有伤心泪水的青春原创动画片。
从小时候起一直青梅竹马的6人，却在升上高中之后彼此有了距离。不太与人们接触的主角宿海仁太、有点被小太妹熏染的安城鸣子、进入重点高中的松雪集与鹤见知利子、放弃读高中而展开旅行的久川铁道、只有幼年死去的本间芽衣子（灵魂，只有仁太能看见）还是一如从前。有一天，芽衣子对仁太说：“帮我实现一个愿望吧”。仁太虽然有点为难，却还是答应帮助面码实现愿望。以此为契机，为了实现芽衣子的愿望，分散在各处的大家又再次地聚集在一起。
女主角桃园奈奈生因好赌而欠债的父亲不知去向，被讨债的人赶出了家。在走投无路之时，她帮助了一位被狗追的懦怯的男人，得知她的遭遇后神秘的男人说出了“我把我的家转让给你吧。”这样出奇的话。无家可归的奈奈生虽然半信半疑，但还是前往了男人所说的住所……到了那儿发现那是一间荒废的神社。那懦怯的男人的正体正是离家出走的土地神。作为神社转让的代价，奈奈生开始了当土地神的新生活。