故事发生在一个类似欧洲中世界的“魔法武士世界”，这世界中的人们信奉“马鲁泽教”，视其教义为真理，而当中的“马鲁泽预言” 更是从未虚假。在有记载的5000多次预言中，仅有二次失误，因此所有国民也都遵照预言行事。
某次，《马鲁泽预言》 指出皇后所诞下的双胞胎中的女孩 (公主) 要立刻杀掉，因为她是会令世界灭亡的猛毒，到她16岁生日时便是猛毒发作的世界末日。正因如此，双胞胎中的女孩便被扔落悬崖杀掉。但15年後，皇室却发觉那女孩竟仍然活著，而且被一对能力很高的姐弟 (义兄义姐) 保护着，由于那女孩快要到16岁，所以皇室展开了一连串的追杀。
也因此， “废弃公主”帕希菲卡便开始了四处走难逃命的旅途…
14岁的爱莉卡·梦宫为了寻找母亲的下落来到了大都市。在那里有着一群被称作“乙HiME”的女性，她们专门为王族或政治家等掌权者提供帮助，成为他们的参谋，是华丽而优雅的社交之花，全世界少女的憧憬。有香被乙HiME们活跃的身影打动，决定成为在最高点的“舞乙HiME”的一员。
曾经孕育了许多“乙HiME”的伽尔德洛偑学院，是无数少女们寄托了梦想的所在，有香加入了想要努力争取进入这所学院的行列之中，并与少女妮娜等人相识。在萦绕着友情与恋情的竞争中，几位少女们渐渐成长着。
五河士道只是一名普通的高校二年生，然而在在四月十日，随着一场奇怪的大爆炸（空间震），意外的与一名身穿盔甲手持大剑的神秘少女相遇。这名少女的正是所谓的“精灵”，是会给世界带来灾难的存在，因此这名少女也正遭到对“精灵部队·AST”的攻击。于是，有着会去帮助有困难、有悲伤的人的温柔性格的士道，主动提出要与精灵进行交涉的任务，随后，士道发现了自己拥有的特殊体质，那就是可以通过接吻，来封印（吸收）精灵力量的能力，并且将精灵受到致命伤恢复再生的能力。
神魔，是从黑暗世界中逃出的潜伏在人们心灵软弱处将人类引导入死亡的一种东西……而将这样神魔再次赶入黑暗世界的就是一位美丽的吸血鬼——美夕。
《吸血姬美夕》TV版中，故事围绕着吸血鬼美夕与她的一个非常可爱的小宠物死无，以及她的朋友（关系暧昧）拉法与神魔间的斗争展开的。基本上是一集打跨一个神魔的单独小故事，但是其中穿插着美夕与一心要打倒她的雪女冷羽和最后的神魔、亦即美夕的好朋友千里之间的恩怨作为主线。
美夕是东方的吸血鬼，奉命守护自己的魔界，与西方习惯意义上的吸血鬼不同，她不是为了伤害人类而存在的恶鬼，而是降妖驱魔的吸血姬。但由于她独特的身份和封印神魔的方式，再加上人与魔不断的互相纠缠，使得吸血姬美夕成为一个在作品中毁誉参半的主角，她救过很多被神魔纠缠的人，也将不少和神魔纠缠甚深的人类送到了冥。就如同双刃剑一般，无法断言成败得失，但相信很多读者都认同于吸血姬美夕的主要原因在于：美夕每一次将人类送到冥间之时，都可以感受到美夕的无奈和发自她心底的悲伤。
某天，世界连结到了一起。突然打开的门Highlow，将5个世界连结。
我们所居住的蓝色世界——地球
夜与魔法所支配的黑色世界——Darkness Embrace
祈祷与诸神所守护的红色世界——Terra Rubri Aurora
科学与电脑所管理的白色世界——System White Egma
武器与军队所统治的绿色世界——Gruneschild
天使、恶魔、妖精、魔女、女神。仅在童话中出现的存在，以现实之物现身。
与此同时，觉醒了特殊能力——Excceed的少女们，开始出现在各个世界。
她们被称作“Progress”，并被集中到对她们展开保护、育成的巨大学园都市“青兰学园”。
在这所学园中，少女们相遇了。
与一同编织起牵绊的伙伴们一起。面对5个世界共同的敌人，将世界导向终焉的“Uroboros”。
这个世界，将要失去。能将其拯救的，唯有被选中的少女Progress们——。
传说，从古至今妖魔就潜藏在人类的世界中，人类对妖魔完全束手无策，于是求助妖魔猎人。妖魔猎人是身材苗条背着巨剑的银瞳女子，她们的身体里混有妖魔之血，可算是半人半妖。因背着巨大的剑，人们故而称呼她们为“大剑”。本作故事正是围绕着大剑中的一员克蕾雅和人类少年拉基，以及其他大剑成员的相遇相知而展开的冒险故事。
那还是人与非人的世界未曾分开的时代。从韩德利克森与都雷法斯两大圣骑士长的支配下夺回王国的“七大罪”以及伊丽莎白、霍克。王国诞生祭也平安结束，和平终于造访了里欧涅丝王国。但，下一个威胁的预兆，确实地在产生着——。不知是否察觉到这股气息，“七大罪”们充分享受着总算到来的日常。但，他们的日常没可能普通地度过……。这是，描绘“七大罪”在面对下一场战斗之前的短暂日子的特别物语！
故事发生在绿色都市——风祭。居住于这座以“文明与绿色共存”为理念而兴建的都市里的天王寺瑚太朗，与神户小鸟、吉野晴彦等伙伴过着平凡的每一天。
在那么和平的风祭市里，每年都有一段时间特别热闹，那就是举城欢庆的收获祭。为了这个类似于文化祭的大型活动，瑚太朗开始干起收集新闻素材的工作。
同一时间，瑚太朗的身边也开始出现种种无法解释的奇怪事件，而在风祭这个地方，正盛行着各种未知生物以及超自然现象之类的流言。瑚太朗开始着手调查这些事件，并向超自然研究会会长千里朱音寻求帮助，还把自己所认识的同学们也一并卷了进来。
这其实是瑚太朗的小小冒险心在作怪。“要是能跟伙伴们一起打打闹闹地生活下去，那该多好啊。”
瑚太朗这时还没有意识到，自己的行动已经和探寻那谁也不知道的“真实”联系在了一起。
——那个女孩的命运，能够被改写吗。
“魔法使派遣公司阿斯特拉尔、提供能满足您所需求的魔法使”——没有任何才能的高中生少年伊庭树, 有着平凡的外表, 右眼因为小时候的意外事故, 带着如海贼般的眼罩, 个性极度胆小, 连看“哆啦A梦魔界大冒险”都能被吓到昏倒。由于父亲伊庭司的失踪超过了七年, 因而继承了父亲的资产, 其中包括了已经没落的某公司的经营权。经营的内容, 竟然是派遣身为魔法师的社员们，解决委托人的疑难杂症，似乎是这家公司的业务？充满幻想的异种魔法格斗故事就此展开。
在从便利商店回家的路上，突然被异世界召唤的少年菜月昴。在无法依靠任何东西东西的异世界，无力的少年手唯一的力量……那是“死去然后重新开始”的力量。为了守护最重要的人们，为了取回确实存在着又无可替代的时间，少年抗拒着绝望，勇敢地面对着残酷的命运。